Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLAIN2Q9P270 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLAIN2Q9P270 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLAIN2Q9P270 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLAIN2Q9P270 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms