Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms