Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP5Q9NZZ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms