Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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