Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKIRAS1Q9NYS0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms