Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC28Q9NX36 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms