Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms