Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEPPQ9NTK1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms