Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms