Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX15Q9NRS6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms