Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGEF4Q9NR80 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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