Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A4GALTQ9NPC4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms