Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNMB3Q9NPA1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB3Q9NPA1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms