Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPJQ9HC77 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPJQ9HC77 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms