Protein–RNA interactions for Protein: Q9H944

MED20, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED20Q9H944 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED20Q9H944 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED20Q9H944 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms