Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf49Q9H6J7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf49Q9H6J7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms