Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN2Q9H4D0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN2Q9H4D0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms