Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF39Q9H2S5 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms