Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOBPQ9H2D6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOBPQ9H2D6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOBPQ9H2D6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOBPQ9H2D6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOBPQ9H2D6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOBPQ9H2D6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOBPQ9H2D6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOBPQ9H2D6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIOBPQ9H2D6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms