Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD4Q9H223 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD4Q9H223 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms