Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHARPINQ9H0F6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHARPINQ9H0F6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms