Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms