Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NYXQ9GZU5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NYXQ9GZU5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms