Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR3CQ9C0K3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms