Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms