Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms