Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCO2Q9BYV7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCO2Q9BYV7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms