Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM55Q9BYV6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM55Q9BYV6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms