Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL3Q9BXA9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms