Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLVAPQ9BX97 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms