Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms