Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf16Q9BUW7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms