Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM43Q9BTV4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM43Q9BTV4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms