Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MESP1Q9BRJ9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms