Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRQ99707 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRQ99707 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRQ99707 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MTRQ99707 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRQ99707 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRQ99707 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRQ99707 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms