Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms