Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCLRE1CQ96SD1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCLRE1CQ96SD1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms