Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSRNP1Q96S65 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms