Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms