Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms