Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC115Q96NT0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms