Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEUROD6Q96NK8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEUROD6Q96NK8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms