Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC138Q96M89 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms