Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC7Q96M83 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms