Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC114Q96M63 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC114Q96M63 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms