Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF4Q96M43 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF4Q96M43 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF4Q96M43 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF4Q96M43 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF4Q96M43 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF4Q96M43 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms