Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP47Q96K76 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms