Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGBD1Q96JS3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms