Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EAF1Q96JC9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EAF1Q96JC9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms