Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX27Q96GQ7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX27Q96GQ7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms